２XXX年、世界は大混乱に陥っていた。ある時を境に人間が妖魔という怪物に変身する事件が多発するようになったのである。原因は不明、昨日隣を歩いていた人間が突然怪物になってしまう非現実的な光景が日常化してしまっていた。 世界各国はこれに対処するため国を挙げて対策部隊を創設した。しかし妖魔たちに対して現存の兵器は有効的な攻撃を与ええることができず、まさしく絶体絶命の状態であった。多くの人間が妖魔という怪物に変わり破壊行為を繰り返す中、彼女たちは現れた。魔法という不可思議な技能を用いて怪物たちを次々と倒していく謎の少女たち。彼女たちが持つ魔法の力は妖魔化した人間を浄化し元に戻すことができる。その力は人類にとってまさしく希望の光であった。世界各国に突然現れ妖魔に唯一対抗できる存在。我々は彼女たちをこう呼ぶ【魔法少女】と。