魑魅魍魎、鬼や悪魔。 そのような怪異と戦う術をもった者を『鬼祓師』と人は呼ぶ。 神道、仏道、そして陰陽道。様々な術を持った鬼祓師達を密かに束ねる組織――飛輪。 飛輪所属の高校生鬼祓師である遠間八代は、先祖代々陰陽師の家系であった。 飛輪結成の大悪魔がよみがえって緊迫が高まる中、八代はとある少女の護衛の任務を受ける。 「こんな大変だって時に、なんでまた？」 疑問をもつも、その少女、黄泉坂深夜の護衛をつとめることになった八代。 だが美少女深夜は天性のトラブルメーカーで、様々なこと（エトセトラ）に八代は巻き込まれてしまう。 やがて深夜の重大なヒミツを知った八代は、とある決断を迫られることになる。 ――救うのは世界か、一人の少女か―― 陰陽師八代と、深夜。そして鬼祓師達の物語。