若き天才魔導士ナタリーとロレンは緊急招集をうけた。それは有史以前より存在する超古代文明遺跡に起きた異変を調査せよというものだった。遺跡の名はフラットヤンハー。総勢２００名を超す調査団がナタリー達を中心に組織され、超古代文明の更なる解析と技術獲得を目指して出立する。 　時を同じくして、元傭兵のハリー・ラスは、一人娘エリスに生じた異変によりフラットヤンハーの存在を知る。 「エリスを失いたくなければ、フラットヤンハーへ向え」 娘の口から発せられた少年の声を聞いたハリーは、昔の戦友であるボルトリー・ボーエンスタンに助けを求め、フラットヤンハーの奥深くへ進入する。 　多くの運命を翻弄してきたフラットヤンハーの秘められた謎が明らかになり、ハリー父娘とボルトリーは生命をかけた戦いを強いられる。