今から少しだけ前の時代。海沿いの街シャロンを舞台にした不思議な物語……。 　街の平和を守るための組織、シャロン警察隊に所属していた少女ファインは、何者かの手によって盗まれた遺物の奪還と犯人確保という任務を受ける。盗まれた遺物の名は、『茜の雪』――それは身に着けた者に人智を越えた能力を授ける禁忌の宝物だった。 　犯人の手掛かりを探すため、ファインはこの遺物をよく知るラークという青年に協力を依頼する。恐るべき力を手にした犯人に対抗するため、ファインもまたラークの下で、『茜の雪』を生み出した禁断の技術、『星の回路』の修業を始める。しかしそれと同時に、彼女の街では次々と怪事件が起こり始め……。

　物理の必修単位を落とし留年の危機を迎えた大学生・冷池進一は、同じく崖っぷちの学友たちを誘って、無人島でバカンス中の物理学教授・白井華への抗議の旅に出る。白井教授が島の中央に建つ研究所『セントラル』の最奥部に引き籠っていることを知った彼らは、彼女に会うためにセントラルの門を叩くが、その時セントラルの内部では奇妙な事件が起き始めていて……。 ※タイトル落ち

　時は近未来。世界は渡良瀬樺音という一人の研究者が作り出した兵器『新時代』の暴走により、地形は変わり建物は薙ぎ払われ、地表の文明は悉く壊滅状態にあった。それでも人類はしぶとく生命活動を続け、更地と化した世界の中に新しい文明の立て直しが行われていた。新時代の影響で天候も、昼夜さえも安定しない世界のなかで、人々は細々とした生活を続けていた。 　とある小都市に暮らす少年・都丸綾文は、ある日旅人を名乗る一人の少女と出会う。ナトリー・フロウと名乗る彼女は、なんと新時代によって世界を焼き払った渡良瀬博士が生み出した最後の人工生命体だったのだ。彼女は優しかった渡良瀬博士が何故世界を焼き払うなどという狂気に至ったのかを知るために、各地を彷徨っている同系の人工生命体を探しているのだと語る。 　ナトリーは『情報収集に最も適している』という理由で、街の小さな喫茶店で働くようになる。そして街で不思議な出来事が起こるたびに、彼女は蛮勇を振るって首を突っ込んでいく。お節介焼きの都丸は、彼女の動向をハラハラしながら見つめるが……。