どこにでもある町の、当たり前の日常。神社の娘、上白きずなはそんな日常で暮らす中学2年生だ。 　ある日、この世とあの世のバランスが崩れ、一ツ目の『お札』を張られたビルが妖怪化。 　人間から恐怖のエネルギーを得るため暴れ始める。 　そんな時、少女を『戦う巫女』へと変えたのは一個の「おむすび」だった。 　その正体は彼女の神社、おむすび神社の神様である！ 　あの世とこの世のバランスを取り戻すため、巫女一族の少女を相棒に選んだのだ。 　変身の一言をつぶやいた時、きずなは白うさぎをモチーフとした巫女装束を身にまとう。 　そして、少女たちは「おむすび」の神様を相棒に、陰陽五行の現代の巫女として活動を開始。 　おばけが起こす事件に対し、ヒロインたちは立ち向かう。 　王道を行く妖怪モノと魔法少女ものの融合、はじまりはじまり！