第１章、主人公坂本雄一（さかもとゆういち）１５才は男の娘である。 そんな彼は日々を退屈に過ごして、いた所神様と名乗る少女から自分が作った世界（男女比１：５０）に来てほしいと頼まれ、神様が経営する学校に通うことになる。 しかし彼は知らない自分以外の男子学生がいないという事と、女子高生に襲われない為女装しつつ、教員（神様見習い）にサポートされながら通うことになるのを。 第２章、雄一は皆に恩を感じており皆の悩みを、解決するもしくは頼みごとを聞く為行動を起こす。 生徒や神様(見習いを含む)の悩みや頼み事は、千差万別で苦労する事が多くなるが、その悩みを転校してきた三上紗綾と共に解決していく。 しかしこの事は次第に様々な人達に知られ恩返しとは、関係の無い人達まで、助ける事になってしまうのを雄一は、知らない。 第３章、雄一の活動が世界的に知られてしまった。 これに焦りを感じた神宮寺沙耶香により東浦学校、祭政学園、明晰学園の三校で、雄一を守る同盟が組まれる事になる。 はたして三校同盟は、雄一を守る事が出来るのか。 個別ルート編、雄一は遊園地に誘った女の子から告白される雄一は、悩みながら女の子とのこれからの事を考えていき。 ハーレムルート編、Ｔ国最高会議にて重婚が検討されていたが、男性が嫌がるという理由で実行されなかった。 しかし雄一で試す事に議員全員が賛成し雄一は、ハーレムを作る事になってしまった。 当然女の子達がこのチャンスを逃すわけがなく。