両親が二人とも女で、しかもそのうち一人が幽霊という奇妙な家庭で育った捻くれ少女、若竹佳代の元に、ある日、怪しげな封筒が届いた。それは、聖エンゼルフィーレ学園死霊魔術科、通称『学園ネクロマンサー』への招待状だった……。

　メッセージとは過去から未来へ贈るもの。大きく分けると二種類のものがある。一つは、過去の失敗を繰り返さないために未来へ警鐘すべきもの。もう一つは、過去の成功を未来でも再現を容易にするために伝えるもの。前者は『戒律』と呼ばれており、後者は『術』として受け継がれている。 　メッセージは伝えるべき人に正しく伝えないと大変なことになる。そこで、メッセンジャーの役割が非常に重要になってくるのだが…。 　平凡な高校生活を送っていた春菜と幸四郎が、ふとしたことからメッセンジャーに選ばれてしまい悪戦苦闘する。彼らは何故メッセンジャーとして選ばれたのか。果たして、二人はその重責をまっとうすることができるのだろうか。