世界は突如、異常事態を喫する超常現象が起きた。 その現象により巨大生物無人（アルカナ）と呼ばれる生物が、人間達の生活を侵食し始めた。 圧倒的力を保有した無人を前に人々に抗う術がないと思われたが、そこで立ち上がった者達がいた。 彼らは謎の巨大生物と戦うためにコード持ちとしての力を遺憾なく発揮する。 そしてーーー。少女シャーロット・アリアもまたコード持ちの意志を受け継いで無人と戦うことを決意する。 彼女は平和を取り戻すため仲間と共に戦うと誓う。 しかし、彼女は無人と戦う他にもう一つ目的があった。 アリアは無人と戦いながら、もう一つの目的を果たすため、独りでに無人に立ち向かって行くのであったーーー。