天動説の先生は、何者？

　時は戦国末期――。 　森の奥深くに一人の武士がやってきた。戦から敗走してきた彼は深手を負い、余命幾ばくもない虫の息だった。そんな彼に、信じられない摩訶不思議な出来事が起きようとしていた。 　時は移り変わって現代――。 　高校三年生となった竹之内善貴は、受験生という自覚を持てないまま、日々を持て余しながら過ごしていた。そんなある日、夏休み前の勉強合宿の最終日に行われた肝試しに参加した善貴は、その最中に行方の分からなくなったクラスの中心的人物、瀬名川悠里を捜索する羽目に。なんとか悠里を発見した善貴だったが、そこで思いもかけない事故に巻き込まれてしまい……。 　事故に巻き込まれて数日。幸運にも命の助かった彼が意識を取り戻した。しかし、そこで目にした光景は自身の知る世界とはまるで違っていた。善貴の中で目覚めたのは、何故か戦国の世を生きた武士だった――！？

江戸時代研究室に所属する大学生 藤堂彰は ある日研究室で古びた手記を見つける。 江戸時代を生きた武士 藤堂直正のものだった。 そこには小姓との衆道(同性愛)についての記録が。 その手記から今の時代とは違う葛藤や背景、 自身にはない強さを知る。 今を生きる自分がこの手記からなにを学べるのか。なにを考えることができるのか。 そして藤堂彰の人生も少しずつ変わり始める。