古来より神による伝説が多く残されている都市、都ノ杜(みやこのもり)市。 この地にある歴史研究所で爆発事故が発生してから、市民の多くが超能力を使えるようになった。 そんな出来事から10年。 都ノ杜市では、神代戦争(しんだいせんそう)が始まろうとしていた。それは、神に選ばれた人間10人によって行われる命を懸けた戦い。 勝ち残った者には祝福＝願いを叶える権利が与えられる。 非能力者の高校生・進堂アラタはある日『神』と名乗る記憶喪失の女の子と出会ったことで、超能力を覚醒する。 そして、神代戦争の参加者となったアラタは自身の願いを叶えるため、戦いに身を投じていく。 これは、世界に絶望した者たち、希望を抱き続ける者たちが、理想、願い、夢をぶつけ合う物語。 正義も悪も表裏一体。最後に生き残った者が、全てを手に入れる。 掴み取れ、己が願いを―――

　「本当に魔法やスキルは存在しないのか？」 　そんな超能力の存在を追い続けた理学少女が、ある日魔法やスキルが存在する異世界に転移した。 　そして、この世界には《UNKNOWN》と呼ばれる超能力に長けた個体が存在するらしい。 　「超能力の知識がない私と、《UNKNOWN》……。これだ！　超能力に長けた者から超能力を学ぼう！」 　やがて彼女は世界最強に……？

西暦2050年……ゲームの歴史が変わった。体験するVRゲームから体感するVRゲームへと進化した。 その名はAlterFrontier（アルターフロンティア） 自分だけのキャラクターを作り、広大な世界を飛び回り、戦って、遊んで、作るなどを体感出来る‼︎ 最初期からプレイしている高ランクプレイヤー、シーカーこと悠斗は今日も友達の将呉と共にAlterFrontierへとログインしゲームを楽しむ。 その最中にとある事件に巻き込まれて、謎の力"炎の刻印"を手に入れた。その能力は本来ない謎に包まれたスキルであり、巨大なモンスターをも一撃で倒す強力なスキルであった。 その力を手に入れた事で、シーカーの世界が一気に広がって行く！ この世界の刻印戦記は少年少女達が送る、小さく、大きなゲームの中にある壮大な物語である。

突如として超能力を覚醒させた者達の戦い。 これは「呪い」の物語。自らに芽生えた力は自らを縛る。その縛る呪いを解く物語である。

特殊部隊も手がつけられないほどの強大な力を持つ犯罪者達を止める、超能力を持つ４人のチームを作るプロジェクト…それが、超人間計画。 それに参加した狩宮涼介は、国の極秘施設にある特殊な装置に入り、超能力を覚醒させる。そして涼介は、仲間と一緒にその左手に宿った不思議な力で、超人的な能力を持つ犯罪者達と戦う！ …っていう、まぁ王道の皮を被った邪道ストーリーなんじゃないんすか。

西暦二二五〇年、一〇〇億人という数の力で地上の七割を支配した《ティターニア帝国》に対して、かつて先進国と呼ばれていた国々が《四つの空中都市》と《各地の要塞都市や人工島》に再編され、わずかな資源や領土、宇宙開発をめぐる戦争が世界各地で行われていた。 　主人公、《天宮スバル》は日本軍の英雄であり、育ての親である男のクローン人間であり、戦争によって天涯孤独の身になってしまった所を、帝国の政治組織に捕らえられてしまう。しかし、政治の道具として生きていく彼の運命は、幸運と不運が重なり、大きく変わることとなった。《神》と名乗る少女が宿るロボット《アークトゥルス》と偶然出会い、契約を交わし、《自分の寿命を削り、人間のコピーを作り出し、それらを使役する》超能力を覚醒させた。 スバルは父と姉を殺したティターニアを破壊する事を誓い、ニッポンの中から孤独な戦いを始める。スバルの行動はあらゆる人間を巻き込み、その運命を変えていくのだった。 これは、ニセモノの青年が、世界を騙し、破壊し、侵略し、時には青春を謳歌し、時には裏切られ――それでも自分だけのホンモノを見つけ出そうとした物語。