両親にも、貴族にも、国民にも愛されず、 「悪徳の皇后」として処刑されたディレッタ。 彼女は、幼き日から人生をやり直す機会を与えられる。 復讐を誓った二度目の生には、思いがけず温かな愛情に触れていく。 一度目では見えなかった陰謀と真実。 すべてを知ったとき、彼女が選んだ答えとは――。

　かつて、この国を変えようとした一人の総理大臣が、既得権益と闇の勢力――「DS（ディープステート）」に挑み、葬られた。 　だが、その残した記録を継いだ官僚と女性記者が立ち上がる。 　封じられた特別会計の闇、操られるメディア、そして告発者を潰そうとする影の圧力。 　彼らは命を懸けて真実を託し、「未来を変える記録」を世界へ届けようとする。 　権力に抗う者たちの勇気と葛藤を描く社会派サスペンス。 　これは、沈黙を破り、未来を選び取ろうとする人々の物語である。

　数々の災難を乗り越え、ようやく魔術学園のある首都アストリアにたどり着いたノード。しかし入学式当日、予期せぬ引ったくり事件に巻き込まれた彼は、思わず見知らぬ少女をかばい、彼女のローブを汚してしまう。 　彼女の名はイリーナ・ソフィア・ル・モリス。王の妾腹として生まれ、政争に巻き込まれて田舎に追いやられた少女。その名は、貴族ならず民の間でもさまざまな噂としてささやかれていた。 　ローブを貸したことでノードは入学式に間に合わず、挙句の果てには侵入者扱いされて取り調べ室送りに。だが彼を迎えに現れたのは、雷のような髪色を持つ担任教師・ルーシェ。彼女に導かれ、ようやく学園の門をくぐったノードは、偶然にも入学式で新入生代表として挨拶をするイリーナの姿を目の当たりにする。 　少女との出会いが運命を動かし、少年の物語が幕を開ける。ここは、選ばれし者だけが集う《エレベイト魔術学園》。友情と対立、陰謀と真実、そして心の揺れ動く瞬間——すべてがここから始まる。

運命の糸によって繋がれた若い魔法使いたちが、神秘的な人形たちと共に運命を操る戦いに挑む。魔法使いの少女たちは、糸を操る力を持つ人形たち「運命の織姫たち」の力を借り、運命の悪意に対抗する。しかし、彼女たちが直面する試練は、運命の糸の絡み合った陰謀と真実を探ることになる。

「これは陰謀です！」 極度の陰謀論者である埋火一禄（うずみびいちろく）は、今日も物事の背後に陰謀を嗅ぎ取り、警鐘を鳴らす。 誰も取り合わない。話半分に聞く者、半分の半分に聞く者、全然聞いてくれない者しかいない。 医療事故の隠蔽。 暴対法の真実。 半導体メーカーの策謀。 政財界の権謀術数。 夜の街を支配するラーメン屋の親父。 家畜とされ、人権を剥奪された無名の民。 誰も、その存在を知らない。知っているのは、埋火を含む有志数名のみだ。 ある時、クラス一の美少女である堀北神流（ほりきたかんな）が、埋火たちが集まる作戦会議室（旧校舎二階の教室）に案内される。 純朴で心優しい美少女を交え、一癖も二癖もある仲間たちが、それぞれの意思をもって陰謀に立ち向かう。 陽キャと陰キャの格差を消し去り、恋愛の平等性を訴える恋愛共産主義者：畦遼鵜（あぜりょうう）。 運命論を説き、右にも左にも寄らない中立こそが理想であると唱えるニュートラル理論提唱者：真壁封弥（まかべふうや）。 世にはびこる誠実はすべてまやかしであると声高に主張する財閥令嬢：鈴鹿来夏（すずからいか）。 彼らは叫び、主張する。たとえ、耳を傾ける者がいなくても。 在るべき理想を追い求め、イデオロギーの海に漕ぎ出していく。 思想強めの少年少女と純真無垢な美少女が織りなす、陰謀と真実の物語。

『お父さんの夢に生きていくわ』 皇帝の側近である「賢者」を父に持つロダは、ある日何の前触れも無く父の処刑を目の当たりにする。 陰に潜む陰謀と真実を解き明かす為、そして父の夢でもあった賢者になり世界を正す願いを叶える為に、長い長い旅路へと向かうのであった。