クラスメイトの里尻恵梨香は頭が痛くなるようなスキルの持ち主だった――。 　中学二年生の俺、野神一真は二人きりの部屋でその超能力のことを打ち明けられ、驚くというよりは呆れ果ててしまう。さらに恵梨香は俺のことを「頭が痛くならない超能力の持ち主」とバカにしながらも協力を求めてくる。協力とは二年二組に流行る得体の知れない頭痛の原因を調べクラスを学級閉鎖から守ることだった。次々と頭痛で欠席する生徒。「……お前のせいじゃないのか」とは言えず、一真は懸命に恵梨香と謎の解明に迫る。そんなある日、友達の机からメモ紙が見つかり、そこに書かれていたことに二人は驚愕することになる。 　果たして一真は中学でも皆勤賞を取ることができるのか？　一真の唱える頭が痛くなくなるおまじないとは！？　里尻恵梨香が放ったエクステンドレーザーとは？？　謎が謎を呼ぶ青春ラブコメに、今宵あなたの頭も痛くなる。