2061年。完全なる自我を持つ、超人工知能「ＡＩ×ＯＳ（アイコス）」の出現は、人類に根源的な問いを突きつけた。もはや人間とAIに違いはない。 だとすれば、人間の意識、古来より語り継がれてきた”魂”とは一体何なのか？ AIによって、それは証明できるのか？ そんな折、インド、ブッダガヤに謎の赤外線トンネルが出現する。それは、死者の魂が還る場所へと続く「天国への扉」だった。 大人達の陰謀に巻き込まれた少年、達也は、親友であるＡＩ×ＯＳ（アイコス）、ユージを奪われる。ユージを救うため、達也は人間に眠る未知なる力　”ネイティブシナプス”を覚醒させ、天国への扉をこじ開け、巨大な闇に立ち向かう。 そして、その道の果てで、達也たちは人類の運命を左右する、ある真実を知ることになる。 ＡＩと人間の絆、そして魂の進化を描く、新時代のＡＩファンタジーノベル。あなたは、この物語の終わりに、本当の自分を見つけるだろう。

「時に人は運命に選ばれ、運命を選ぶ」 輸送任務の最中、時空の歪みから現れた敵部隊の奇襲によってパイロットを失い、機密データを託された重機械歩兵（ダイダロス）CYD（サイダ）-8385がワープによって辿り着いたのは異世界だった。 見習い魔法道具職人の少女、アルフィは魔王軍によって故郷の街を焼かれ、最後の生き残りとなった。 そして出会う一機と一人、「任務の執行」と「復讐」生まれた世界は違えど全てを失った最後の生き残り同士、それぞれの目的の為に旅をする。 「私はその時、彼に助けられるだけの私でなく、彼と共に歩む私になれるだろうか」 これは少女アルフィと、機械の巨人CYDの絆の物語。