中学3年生になった結は、受験勉強の日々に追われながらも、神様の気配をそばに感じていた。 文化祭、合唱祭、そしてハロウィンの夜――。 過去に出会った人々との再会や、新しい友情を通じて、「神様」と「白石くん」と「わたし」の関係は大きく変わっていく。 そして迎える卒業の日。 少年時代の終わりと未来への旅立ちを前に、結と白石くんと神様は、どんな答えを見つけるのか。 青春と祈りが交差する、シリーズ完結編。

日向結（ひなたゆい）は不思議なことが大好きな、中学2年生。 前方後円墳の自由研究がきっかけで、［神様］が降りてくるようになった白石くんといっしょに、 ［思考］［感情］［情報］［魂］をめぐる知的大冒険に巻き込まれていく旅の記録。 秋から冬、そして春へと移る季節のなか、 宮内庁秘密組織、アメリカ宇宙軍の思惑が絡み合う情報戦に、結は最後の決断を下す。 『中２の夏、白石くんが神様になった』の続編。

５秒前のあらゆる光景を認識することのできる一人の自動車販売員、浅田一樹は、ふとしたきっかけから、その能力を持つが故に国家の重大事に巻き込まれていく。

何だこのはにわ！……何がそんな驚くの！？ とある歴史学者とはにわの日常…

　主人公波多幾雄は亡父から波多家のお宝探しを託される。 心強いパートナー古川安男、良き伴侶斉田志保を得る。波多幾雄はご先祖のお宝は渡来人秦氏の秘宝ではないかと考える。秦氏は殖産から土木事業、神社、寺院建立など、幅広く活躍した支族である、 　秦氏は遠くさかのぼればユダヤ人ではないかという説が濃厚になってくる。ユダヤ人であっても、彼らは原始キリスト教徒ではなっったかというものだ。とすればキリストに関するお宝と考えられるが、秦氏が持ち込んだ神社、寺院建築にはキリスト教に関係するものは一切ない。 　その理由はただ１つ、彼らは自分達をキリスト教徒と考えてはいなかったのだ。ユダヤ教の一派、エルサレム教団と考えていたのだ。 　それともう１つ、彼らよりも先に日本にやってきたユダヤ人たちがいた。ユダヤ人は十二の支族がいた。古代にそのうちの二支族がユダヤに残った。後の十支族は忽然と歴史の舞台から姿を消している。この失われた十支族が日本にやってきたのではないかと波多達は考えた。 　後にエルサレム教団とユダヤの十支族は日本で融合する。とすれば秦氏のお宝とはユダヤに三種の神器の内の”神との契約の聖櫃アーク”しかない。これが日本に持ち込まれたと推理した。 　波多幾雄、斉田志保、古川安男達のお宝さがしが軌道に乗り始めたとき、彼らの周辺に不穏な影が蠢き始める。 　応神天皇陵で古川安男と斉田志保が拉致される。黒い影の男が波多幾雄に言う。 「２人を返してほしければ、今後はお前１人でお宝探しに専念しろ」