未来は過去からやってくる 　実は太陽は2600万年周期で近接する恒星ネメシスとの連星であった。 　ネメシスにも惑星がありそこには知的生命体が存在している。 　その脅威に対抗すべく古代地球人が造り出したのが、『縄文式玉髄（ぎょくずい）』と呼ばれる全身を縄目模様で包まれた、石英をベースとした人型機構である。 　その多くは月面の地下で生産され今でもそこに保管されているが、地上にも数体が残されている。地上の玉髄にはその胸部に、神代文字であるカタカムナ文字でナンバリングが施されている。 　再開された有人月面飛行で、月に降り立った米空軍所属のエリックは、地下空洞で玉髄と遭遇し融合する。エリックから現代社会の情報を得た玉髄イオイラは、人類の滅亡を防ぐために現人口の大部分を淘汰する事を決め、地球のエリア51に飛来する。 　一方月面の玉髄が起動した事を察知して、地球上の玉髄も縄文人のDNAを色濃く受け継いだ琢磨と融合する事で起動する。 　玉璽は太陽から地球に降り注ぐ波動をエネルギー源とするが、月面の玉髄が陰波を使うのに対して地球上の玉髄は陽波という逆の位相を持つ波動を動力源とする。 　地球上の現存兵器ではこの波動を使ったシールドは突破する事ができない。しかし二つの波動は互いに打ち消し合う事でお互いへの攻撃が可能となる。 　人類の淘汰を阻止しようとする地球上の玉髄と、月面の玉髄たちとの戦いが始まる。奇しくも両者の目的は同じく人類の存続である。

地球とは異なる文明が発展する惑星ミール。現代ミール学者をも悩ませる謎がある。 『サマラ』の3大ピラミッド。密林の中に突如現れる謎の古代神殿『ホルス』。月にあるとされる旧文明の遺跡『ボーフ』。最古の神が描かれている巨大壁画『デスク』。 天まで届いたと文献に記載されている塔『イグラーチ』。『ペルミ』の地上絵。そして、―― 大半が大洪水で消え去ることになったが痕跡は存在する。 同じ時期に誰が何の目的のために造ったのか。その時代に存在してはならないものがなぜあるのか？ 全ての始まりは、オカルト好きな青年が異世界に転生したことから始まった。