時は西暦１９４１年の日本を取り巻く状況は最悪と言っていい状態であった。 　１９３１年、名将“石原莞爾”中将直々の満洲事変を切っ掛けに中国と泥沼状態の戦いに陥ると共に米国との関係も日が経つにつれて極端に悪化していた。 　政府や軍部は最早、対米戦争を回避できない事態を考慮して一撃必殺の作戦を以て米国に大打撃を与えて早期講和を締結してこの泥沼の状況から脱しようと考えていたのである。 　その一環として最初における作戦として連合艦隊司令長官『山本五十六』大将提案の真珠湾上陸作戦及び米国本土上陸作戦が採用されて現時点での最新鋭空母を含む大機動部隊を投入する事が決定される。 　だが、その作戦に石原莞爾がとんでもないことを新たに提案してくる。 　そこから新たな歴史のイチページが開かれることになる。 　昭和１６年１１月２８日、択捉島単冠湾から『南雲忠一』中将率いる第一機動部隊が出航する。 　航空母艦“赤城”“加賀”“蒼龍”“飛龍”“瑞鶴”“翔鶴” 　戦艦　　　“比叡”“霧島” 　巡洋艦 “利根”“筑摩””阿武隈“ 　駆逐艦 “谷風””浦風””浜風””磯風””陽炎”“不知火”“霞”“霰”“秋雲” 艦載機　 ３５０機 日本陸軍３個師団を満載した大輸送船団と共に……。 ここから新たな歴史が記されていく。

１９９９年８月、大東亜戦争を戦い抜いて戦後BC戦犯として服役した一人の老人が老衰のため、天に召されようとした時に不思議な事が起きて気が付くと昭和２０年代に戻ると共に姿形も当時のままであった。 　その軍人の名は『日下敏夫』海軍中佐で世界初の潜水空母“伊４００”の艦長であると共に僚艦の“伊４０１”“伊１３”“伊１４”と共にパナマ運河攻撃出撃前夜であった。 　しかし彼の記憶には、パナマ運河の代わりにウルシー環礁攻撃に変わったはずだがこの世界と彼がいた世界は微妙に違う世界である。 　それから運命に導かれて未来の世界へジャンプした後、そこで別次元の兵器に生まれ変わった潜水艦“伊４００”は、別世界の日本国滅亡を阻止する為に最新鋭護衛艦である“さがみ”と共に再び過去に戻り大暴れをして日本国滅亡が決定されている運命を破壊する事である。